Для начала вам понадобится программа 
VirtualDubMod (скачать 
здесь), потом вам нужно скачать 
здесь фильтр для "вшития" субтитров и закинуть его в папку "
plugins"
После этого заходим в VirtualDubMod и открываем нужный нам фильм 
File > Open Video FileДалее нам нужно добавить сам фильтр в VirtualDubMod 
Video > Filters > Add > TextSubПосле этого вам предложит программа выбрать (открыть) субтитры
Теперь в меню 
Video>Compression(что бы у вас был активен этот пункт, у вас должно стоять чуть ниже 
"Full Processing Mode") выбираете нужный вам, кодек формат и т.п. для расчеа размера можете так же использовать имеющийся внизу калькулятор, который высчитает нужный вам битрейт фильма с учетом продолжительности и т.п. 
После того, как вы сделали все нужные настройки сохраняем фильм 
File>Save as уже с субтирами и через некоторое время все будет готово. Удачи!
Сайты, на которых есть субтиры можно найти 
здесь