Имхо, для разных форматов стоит пользоваться разными простыми редакторами (если речь о них) они удобнее и могут быть более навороченными по отдельности для своего типа файла.
Советую:
Форматы:
MP4 -
MP4Box иили сразу Yamb = резка, склейка, разделение на потоки и создание с нуля.
AVI -
VirtualDubMod - он много чего умеет. И конвертировать тоже. Обратите внимание название именно
VirtualDubMod
AVI, MP4, FLV -
Avidemux 2.4 GTK+ или выше версией - многое умеет
MKV -
MKV Toolnix - для резки и склейки.
MKVExtract - разборка на потоки
Качать все вышеперечисленное лучше всего отсюда
https://www.videohelp.com
или по ссылкам на этом сайте.