Изложено очень сумбурно, туманно.
И Вам нужно в соответствующей теме бы задать вопрос.
Раз уж тут, скажу следующее.
Если написано фильм xvid, то и нужно было резать не програмой MPEG Video Vizrad, а в VirtualDub е.
Бесплатная, простая программа и при резке не нужно кодировать, а просто пересохранить в прямопотоковой обработке. Если хотите поточнее, то ставить полную обработку видео и дополнительно галочку на "умный реиндеринг" е.
И получиться намного быстрее и все прекрасно.
MPEG Video Vizrad - тоже хороший и довольно простой, но со своими ньюансами. Один из которых, хотя работать с Avi и научили, делать без пережатия он их не может. И при не умелой работе он их еще и коверкает.