Ничего страшного. Вам нужно контроллер с внешними гнездами 1394 на 4 и 6 контактов. Обычно бывает два 6-контактных гнезда и одно 4-контактное. Про внутренние разъемы 1394 лучше вообще не заморачиваться. Внутреннее подключение платы (то, чем она подключается к материнке) лучше брать по шине PCI. Она более старая и наверняка есть на вашей матери. Если вы возьмете ретайловую версию, то плата будет в коробке, к ней обычно диск с драйверами, коротенькое описание и провод для подключения камер с интерфейсом 1394. Но иногда диск дают и к OEM'ной версии, надо уточнять.
Что касается чипсета контроллера, у нас идут NEC, VIA, Texas Instruments. Данных о том, что лучше, у меня нет. Думаю, что они все будут нормально работать. В случае чего, поговорите с продавцом.