А вы точно знаете, что звуковая дорожка точно подходит к этому видео. Возможно, в ней были вырезаны какие-то фрагменты (например, во время рекламы). Тогда вам придется в ручную подгонять. Где-то вставлять (тишину, к примеру), а где-то вырезать лишнее.
Почитайте
ЗДЕСЬ по-подробнее.
А чтобы устранить сдвиг в начале, в VirtualDub в Stream=>Stream List кликнуть правой кнопкой на Interleaving и в строке Delay Audio track by выставить значение -1000ms (ваша 1 сек.)