Рассинхрон будет в любом случае. Если Вам повезёт, то передвинув всю звуковую дорожку звук совпадёт во всех частях фильма, но может случится такое, что в начале будет звук и фильм совпадать, а протяжении фильма рассинхрон увеличится. Тут действительно будет сложно, даже описывать процесс обработки не буду )).