Убираем торрент файлик из клиента, не удаляя закаченные серии- именно он сигналит, что уже присутствует в программе. Идем на страницу с раздачей, и открываем обновленный торрент файлик в клиенте, указав путь к папочке с половиной серий.
Имеющаяся половина перехешируется (то бишь, проверится на соответствие), и начнет загружаться отсутствующая половина.