Хм, не понятна цель подобных изысков. Указанная вами программа предназначена для удаления составных контейнера, а не извлечения. Хотите именно извлечь, используйте
//forum.kinozaltv.life/showpost.php...24&postcount=4 Потом можете его же добавить обратно уже в mkv merge